March 20th, 2020

Показатели смертности от коронавируса

Только голые цифры по состоянию на вчерашние сутки:
Страна  Умерли  Фикс  Доля
Италия    3405    33  103
Китай     3245    81   40
США        150     9   16,7
Ю.Корея     94   8,6   10,9
Япония      37   1,5   24,7
Россия       1   0,2    5
Израиль      0  0,57    0

Третий столбец - зарегистрированные случаи заражения в тысячах. Доля - в промилле.
В продолжение https://matholimp.livejournal.com/1892349.html , https://ru-teachers.livejournal.com/25990.html , https://matholimp.livejournal.com/1888596.html и далее по ссылкам.
promo matholimp november 26, 17:30 55
Buy for 10 tokens
Дистанционное обучение внезапно оказалось в тренде. Поэтому пишут о нём сейчас все, кому не лень, вплоть до вездесущего Онищенко. В итоге громкое большинство минимум в 99% составляют публикации несведущих профанов. А 9 из 10 написанных педагогами статей о дистанционном обучении явно свидетельствуют…

Что «не так» со статистикой смертности от коронавируса?

В предыдущей записи я выложил голые показатели смертности от коронавируса по некоторым странам. Я даже не пытаюсь настаивать, будто доля умерших должна быть везде одинаковой. Но столь сильный разнобой побуждает искать объяснение.
Одна причина лежит на поверхности. Некорректно делить число умерших на общее количество всех зарегистрированных случаев заражения. Нужно пунктуально по датам делить число умерших в конкретный день на число заболевших неделей раньше. И делать это не в целом по стране, а отдельно для каждого из очагов заражения внутри неё.
Но почему именно неделей раньше? Потому что так определена продолжительность острой фазы болезни. Но определена она весьма приблизительно. Если заменить неделю на 5, 10 или 15 дней, то итоговые цифры изменятся весьма радикально. Это вторая причина.
Третью причину назвал Алексей Потехин : “При этом показатели общего числа случаев, конечно, очень сильно занижены, так как масса людей перенесла инфекцию бессимптомно и в период, когда ее еще не умели выявить”. Зарегистрированные случаи заражения не только весьма далеки от полной выборки, но не обладают даже качеством репрезентативности. Фактически это означает, что всю собранную на данный момент статистику следует считать крайне недостоверной и сильно заниженной оценкой.

Праздник ритейла, валютных спекулянтов и не только

Если бы коронавируса не было, то его нужно было бы придумать. Нас пугают рецессией и обвалом экономики, но реальная картина пока прямо противоположная.
За последние 6 лет вынужденная изображать благополучие и нуждавшаяся в поддержке электората российская власть напечатала много необеспеченных товаром денег. При этом политическая ситуация в стране исключала девальвацию рубля, из-за чего реальную инфляцию приходилось маскировать. Продолжаться слишком долго это не могло.
Пандемия позволяет Путину успешно списать свои внутренние проблемы на внешние причины. Ослабление рубля выглядит следствием падения цен на нефть. А рост розничных цен - взрывом спроса на товары второй необходимости и продукты длительного хранения. За ростом продаж подтянется и производство. А огромная масса рядовых россиян радостно потратит залежавшиеся без дела излишние запасы наличности.

В продолжение https://matholimp.livejournal.com/1893096.html , https://matholimp.livejournal.com/1892349.html , https://matholimp.livejournal.com/1892823.html , https://matholimp.livejournal.com/1888596.html , https://matholimp.livejournal.com/1888121.html , https://ru-teachers.livejournal.com/25753.html , https://matholimp.livejournal.com/1887827.html , https://matholimp.livejournal.com/1885661.html , https://russ-politics.livejournal.com/4780158.html , https://matholimp.livejournal.com/1886349.html , https://arktal.livejournal.com/817205.html , https://matholimp.livejournal.com/1886046.html , https://russ-politics.livejournal.com/4779911.html , https://matholimp.livejournal.com/1885721.html , https://matholimp.livejournal.com/1885021.html , https://matholimp.livejournal.com/1884721.html , https://matholimp.livejournal.com/1883245.html , https://russ-politics.livejournal.com/4773406.html , https://matholimp.livejournal.com/1880164.html , https://ingria-art.livejournal.com/733959.html , https://matholimp.livejournal.com/1882697.html и др.

Как в разных странах спасают пожилых от коронавируса

Как известно, в зоне риска 60+ и особенно 80+. Тогда как дети болеют бессимптомно, но служат самыми активными переносчиками вируса.
В Финляндии людям старше 70 лет рекомендовано оставаться дома в условиях, близких к карантину. Они должны избегать любых контактов с другими людьми. Премьер-министр Санна Марин напомнила, что в случае, если пожилые люди будут игнорировать рекомендации властей, правительство может ввести и более жесткие меры, например, запретить передвижение на улице. (Перевод новостей Yle)
А в украинском Запорожье (не путать с Запарижьем!) временно прекратят возить пассажиров-льготников бесплатно. Об этом заявил мэр города Владимир Буряк в своём Facebook. Как он сообщил, решение было принято городской комиссией по чрезвычайным ситуациям, чтобы снизить угрозу массового заболевания людей, особенно пожилых, и в вместе с тем дать возможность нормально добираться на работу и с нее тем, кто не имеет возможности работать дистанционно. (С https://strana.ua/news/256146-v-zaporozhe-reshili-otmenit-besplatnyj-proezd-dlja-lhotnikov.html ).

В продолжение https://matholimp.livejournal.com/1893096.html , https://russ-politics.livejournal.com/4782728.html , https://matholimp.livejournal.com/1892349.html , https://matholimp.livejournal.com/1892823.html , https://matholimp.livejournal.com/1888596.html , https://matholimp.livejournal.com/1888121.html , https://ru-teachers.livejournal.com/25753.html , https://matholimp.livejournal.com/1887827.html , https://matholimp.livejournal.com/1885661.html , https://russ-politics.livejournal.com/4780158.html , https://matholimp.livejournal.com/1886349.html , https://arktal.livejournal.com/817205.html , https://matholimp.livejournal.com/1886046.html , https://russ-politics.livejournal.com/4779911.html , https://matholimp.livejournal.com/1885721.html , https://matholimp.livejournal.com/1885021.html , https://matholimp.livejournal.com/1884721.html , https://matholimp.livejournal.com/1883245.html , https://russ-politics.livejournal.com/4773406.html , https://matholimp.livejournal.com/1880164.html , https://ingria-art.livejournal.com/733959.html , https://matholimp.livejournal.com/1882697.html и др.

Кавголовский трамплин, недотаявшие остатки прибрежного льда и бегущий белый пёс

Сегодня, три часа назад.
IMG_20200320_163146
(С) Фотография Федотова (matholimp) Валерия Павловича 20 марта 2020 года.
В продолжение https://ingria-art.livejournal.com/734960.html , https://matholimp.livejournal.com/1889907.html , https://ingria-art.livejournal.com/734655.html , https://voda-78-ru.livejournal.com/148601.html и https://voda-78-ru.livejournal.com/148316.html .

Это уже опровергли или наоборот?

С https://chemrxiv.org/articles/Repurposing_Therapeutics_for_the_Wuhan_Coronavirus_nCov-2019_Supercomputer-Based_Docking_to_the_Viral_S_Protein_and_Human_ACE2_Interface/11871402/3 :

Repurposing Therapeutics for COVID-19: Supercomputer-Based Docking to the SARS-CoV-2 Viral Spike Protein and Viral Spike Protein-Human ACE2 Interface
Version 3 (old) preprint revised on 26.02.2020, 19:14 and posted on 27.02.2020, 09:54 by Micholas Smith Jeremy C. Smith
The novel Wuhan coronavirus (SARS-CoV-2) has been sequenced, and the virus shares substantial similarity with SARS-CoV. Here, using a computational model of the spike protein (S-protein) of SARS-CoV-2 interacting with the human ACE2 receptor, we make use of the world's most powerful supercomputer, SUMMIT, to enact an ensemble docking virtual high-throughput screening campaign and identify small-molecules which bind to either the isolated Viral S-protein at its host receptor region or to the S protein-human ACE2 interface. We hypothesize the identified small-molecules may be repurposed to limit viral recognition of host cells and/or disrupt host-virus interactions. A ranked list of compounds is given that can be tested experimentally.

Submission date
19.02.2020

First online date
20.02.2020

Posted date
27.02.2020

Email Address of Submitting Author
msmit316@utk.edu
Institution
The University of Tennessee, Knoxville & Oak Ridge National Laboratory
Country
USA
ORCID For Submitting Author
0000-0002-0777-7539
Declaration of Conflict of Interest
None
Version Notes
Version 3. Updated compression of gzipped-tarball and cleaned directory tree within SI to make it easier to use.

В продолжение https://matholimp.livejournal.com/1893417.html , https://matholimp.livejournal.com/1893096.html , https://russ-politics.livejournal.com/4782728.html , https://matholimp.livejournal.com/1892349.html , https://matholimp.livejournal.com/1892823.html , https://matholimp.livejournal.com/1888596.html , https://matholimp.livejournal.com/1888121.html , https://ru-teachers.livejournal.com/25753.html , https://matholimp.livejournal.com/1887827.html , https://matholimp.livejournal.com/1885661.html , https://russ-politics.livejournal.com/4780158.html , https://matholimp.livejournal.com/1886349.html , https://arktal.livejournal.com/817205.html , https://matholimp.livejournal.com/1886046.html , https://russ-politics.livejournal.com/4779911.html , https://matholimp.livejournal.com/1885721.html , https://matholimp.livejournal.com/1885021.html , https://matholimp.livejournal.com/1884721.html , https://matholimp.livejournal.com/1883245.html , https://russ-politics.livejournal.com/4773406.html , https://matholimp.livejournal.com/1880164.html , https://ingria-art.livejournal.com/733959.html , https://matholimp.livejournal.com/1882697.html и др.

Early research on existing drug compounds via supercomputing could combat coronavirus

С https://www.ornl.gov/news/early-research-existing-drug-compounds-supercomputing-could-combat-coronavirus :

OAK RIDGE, Tenn. March 5, 2020 – Researchers at the Department of Energy’s Oak Ridge National Laboratory have used Summit, the world’s most powerful and smartest supercomputer, to identify 77 small-molecule drug compounds that might warrant further study in the fight against the SARS-CoV-2 coronavirus, which is responsible for the COVID-19 disease outbreak.
The two researchers performed simulations on Summit of more than 8,000 compounds to screen for those that are most likely to bind to the main “spike” protein of the coronavirus, rendering it unable to infect host cells. They ranked compounds of interest that could have value in experimental studies of the virus. They published their results on ChemRxiv.
The idea was born out of an interest in the coronavirus’ entry point into a host cell. When Chinese researchers sequenced the virus, they discovered that it infects the body by one of the same mechanisms as the Severe Acute Respiratory Syndrome, or SARS, virus that spread to 26 countries during the SARS epidemic in 2003. The similarity between the two virus structures facilitated the study of the new virus.
Jeremy C. Smith, Governor’s Chair at the University of Tennessee and director of the UT/ORNL Center for Molecular Biophysics, worked from the assumption that the two viruses may even “dock” to the cell in the same way.
Team member and UT/ORNL CMB postdoctoral researcher Micholas Smith built a model of the coronavirus’ spike protein, also called the S-protein, based on early studies of the structure.

“We were able to design a thorough computational model based on information that has only recently been published in the literature on this virus,” Micholas Smith said, referring to a study published in Science China Life Sciences.
After being granted computational time on Summit through a Director’s Discretionary allocation, Micholas Smith used a chemical simulations code to perform molecular dynamics simulations, which analyze the movements of atoms and particles in the protein. He simulated different compounds docking to the S-protein spike of the coronavirus to determine if any of them might prevent the spike from sticking to human cells.
“Using Summit, we ranked these compounds based on a set of criteria related to how likely they were to bind to the S-protein spike,” Micholas Smith said.
The team found 77 small-molecule compounds, such as medications and natural compounds, that they suspect may be of value for experimental testing. In the simulations, the compounds bind to regions of the spike that are important for entry into the human cell, and therefore might interfere with the infection process.
After a highly accurate S-protein model was released in Science, the team plans to rapidly run the computational study again with the new version of the S-protein. This may change the ranking of the chemicals likely to be of most use. The researchers emphasized the necessity of testing of the 77 compounds experimentally before any determinations can be made about their usability.
“Summit was needed to rapidly get the simulation results we needed. It took us a day or two whereas it would have taken months on a normal computer,” said Jeremy Smith. “Our results don’t mean that we have found a cure or treatment for the Wuhan coronavirus. We are very hopeful, though, that our computational findings will both inform future studies and provide a framework that experimentalists will use to further investigate these compounds. Only then will we know whether any of them exhibit the characteristics needed to mitigate this virus.”
Computation must be followed by experiment. Computational screening essentially “shines the light” on promising candidates for experimental studies, which are essential for verifying that certain chemicals will combat the virus, according to Jeremy Smith. The use of a supercomputer such as Summit was important to get the results quickly.
This research was funded by the Laboratory Directed Research and Development program and used resources of the OLCF, a DOE Office of Science User Facility located at ORNL.
UT-Battelle manages Oak Ridge National Laboratory for DOE’s Office of Science, the single largest supporter of basic research in the physical sciences in the United States. DOE’s Office of Science is working to address some of the most pressing challenges of our time. For more information, visit https://energy.gov/science. – Rachel Harken

Media Contact
Sara S Shoemaker
shoemakerms@ornl.gov, 865.576.9219

В продолжение https://matholimp.livejournal.com/1893417.html , https://matholimp.livejournal.com/1894039.html , https://matholimp.livejournal.com/1893096.html , https://russ-politics.livejournal.com/4782728.html , https://matholimp.livejournal.com/1892349.html , https://matholimp.livejournal.com/1892823.html , https://matholimp.livejournal.com/1888596.html , https://matholimp.livejournal.com/1888121.html , https://ru-teachers.livejournal.com/25753.html , https://matholimp.livejournal.com/1887827.html , https://matholimp.livejournal.com/1885661.html , https://russ-politics.livejournal.com/4780158.html , https://matholimp.livejournal.com/1886349.html , https://arktal.livejournal.com/817205.html , https://matholimp.livejournal.com/1886046.html , https://russ-politics.livejournal.com/4779911.html , https://matholimp.livejournal.com/1885721.html , https://matholimp.livejournal.com/1885021.html , https://matholimp.livejournal.com/1884721.html , https://matholimp.livejournal.com/1883245.html , https://russ-politics.livejournal.com/4773406.html , https://matholimp.livejournal.com/1880164.html , https://ingria-art.livejournal.com/733959.html , https://matholimp.livejournal.com/1882697.html и др.

Карантин на пользу гениям

С https://www.forbes.ru/forbeslife/395257-kak-samoizolyaciya-vo-vremya-velikoy-chumy-pomogla-isaaku-nyutonu-sovershit :
На фоне эпидемии коронавирусной инфекции некоторые вспоминают историю, как из-за холерного карантина в Москве в 1830 году поэт Александр Пушкин был вынужден три месяца просидеть в семейном поместье в селе Болдино. «Болдинская осень» стала наиболее продуктивным периодом в его творчестве — поэт завершил работу над «Евгением Онегиным», «Повестями Белкина» и «Маленькими трагедиями».
Пушкин был не единственным, чей творческий гений усилило вынужденное уединение. В 1665 году в Англии разразилась эпидемия чумы. Занятия в кембриджском Тринити-колледже были прекращены, а весь преподавательский состав и студенты распустили на карантин по домам на неопределенный период. Среди уехавших был и Исаак Ньютон, которому было чуть за 20. Он покинул колледж, взяв с собой книги, записи и инструменты, и отправился в Вулсторп — родовое поместье в графстве Линкольншир, расположенное в 60 милях к северо-западу от Кембриджа. Свои главные открытия (прежде всего — закон всемирного тяготения) он совершил именно в продолжительной самоизоляции во время «чумных лет».
...
Период с 1664 по 1666 год биографы Ньютона описывают как anni mirabiles в его жизни. К этому периоду, как он говорил сам, относится целый ряд его математических открытий, на которые не способен был ни один из современников Ньютона. Он открыл, по его собственной терминологии, «метод текучих количеств, или плавных переходов», известный нам как интегральное исчисление, «исчисление производных», то есть дифференциальное исчисление, и «теорию цвета».
В вынужденном уединении он «начал думать о силе тяготения, действие коей простирается вплоть до орбиты Луны». Кроме того, он «вывел, что силы, удерживающие планеты на своих орбитах, должны быть обратно пропорциональны квадрату расстояний от центров, вокруг коих они обращаются». Так Ньютон оказался на пороге великой революции в человеческом мышлении, которую позже назовут его именем. Ему постепенно начали приоткрываться тайны света и гравитации. Как сам он мимоходом заметил, «в те дни я был в расцвете изобретательского возраста и уделял математике и философии больше умственного внимания, нежели когда-либо после»

В продолжение https://matholimp.livejournal.com/1894219.html , https://matholimp.livejournal.com/1893417.html , https://matholimp.livejournal.com/1894039.html , https://matholimp.livejournal.com/1893096.html , https://russ-politics.livejournal.com/4782728.html , https://matholimp.livejournal.com/1892349.html , https://matholimp.livejournal.com/1892823.html , https://matholimp.livejournal.com/1888596.html , https://matholimp.livejournal.com/1888121.html , https://ru-teachers.livejournal.com/25753.html , https://matholimp.livejournal.com/1887827.html , https://matholimp.livejournal.com/1885661.html , https://russ-politics.livejournal.com/4780158.html , https://matholimp.livejournal.com/1886349.html , https://arktal.livejournal.com/817205.html , https://matholimp.livejournal.com/1886046.html , https://russ-politics.livejournal.com/4779911.html , https://matholimp.livejournal.com/1885721.html , https://matholimp.livejournal.com/1885021.html , https://matholimp.livejournal.com/1884721.html , https://matholimp.livejournal.com/1883245.html , https://russ-politics.livejournal.com/4773406.html , https://matholimp.livejournal.com/1880164.html , https://ingria-art.livejournal.com/733959.html , https://matholimp.livejournal.com/1882697.html и др.